办公室

    承担行政事务、综合协调、内部管理制度拟定并落实等工作；承担文字综合、信息宣传、安全生产、后勤服务等工作。

人事教育处（离退休人员工作处）

承担制定人事管理制度，承担院机构编制、人事管理、劳动工资、保险、教育培训、人才引进、人事档案、专业技术职称评审等工作。承担离退休人员服务等工作。

财务处

制定院内部财务管理制度，承担全院经费的预决算和各类资金使用的核算，开展资金使用监督；负责院固定资产的核算与管理；参与院重大经济政策的制定和投资行为的决策，参与大宗物资采购和建设工程的招投标审议；承担综合计划、资金调控、资金往来结算、财务统计；承担全院绩效评价工作。

科研与信息管理处

    编制全院科技发展规划并组织实施，组织制订全院科研管理的政策、规定；承担全院科研计划编制及科研项目管理等工作；开展科技合作与交流工作；承担院科技创新团队建设与项目管理、维护知识产权权益工作；负责院学术委员会的日常管理及学术活动的组织协调工作；负责全院图书、科技信息、科技档案管理工作。

荒漠化研究所

开展荒漠化防治技术、植被恢复与生态服务功能评价、土壤改良、微生物与肥料、沙地生物资源保护与经营利用技术等方面的应用基础研究和应用技术研究。

50多年来先后在内蒙古沙区重点开展应用技术和应用基础研究课题共计80多项。获国家科技进步二等奖1项，省部级一等奖2项、二等奖4项、三等奖2项。科技人员先后参与编著或主编专著14部。享受国务院政府特殊津贴4人。 现有科技人员10名，其中研究员5人，副研究员1人，高级实验师1人，工程师3人。学历结构：博士3人，硕士2人，本科4人，专科2人。 以自主创新为基础,围绕内蒙古沙区生态建设中存在的制约因素，开展关键技术研究。 在荒漠化土地发生演化及其与社会经济发展偶合机制、风沙移动规律、沙区近自然植被结构的优化配置及其防风阻沙机理等方面开展应用基础研究；在沙区植被恢复综合配套技术、退化土地综合治理技术、沙区生态环境监测与效益评价、沙生植物资源开发经营利用与品种选育等方面开展应用技术研究。

森林生态研究所

开展森林、湿地、生物多样性保护与利用技术、生态系统服务功能监测与评价、退化生态系统修复技术、自然保护地建设与管理技术等方面的应用基础研究和应用技术研究。

林业研究所

开展造林技术、森林资源培育、林业机械、经济林、林下经济等方面的基础研究和应用技术研究。

林业研究所是内蒙古林业科学研究院重要的职能部门之一，为本院的科技发展做出了突出的贡献，主要职能是面向内蒙古自治区林业生产，进行造林理论与技术、苗木培育理论与技术、经济林栽培与利用等学科方面的研究与技术应用，林业机械研发，新型实用技术、创新成果的推广与示范等。本部门现有科技人员9名，其中具有正高级职称的人员4名，具有副高级职称的人员2名，具有初级职称人员3名，具有硕士学历的人员2名，首席专家2人，专家3人，人员配备合理，学术团队精良。

本部门现承担的项目有中央财政林业科技推广项目“山杏林丰产配套技术推广示范”、“小林果实采收技术及配套装备成果推广与示范”；科技部农业科技成果转化资金项目“三种优良灌木繁育配套技术成果转化及推广示范”、“干旱阳坡生态灌木仿真直播造林技术成果转化与示范”，财政部公益性行业科技专项“兴安落叶松与华北落叶松速生丰产栽培技术研究”，内蒙古林业厅重点科技支撑项目“内蒙古自治区造林立地类型划分、质量评价及适地适树研究”、“阴山北部农牧交错区小叶锦鸡儿灌木林合理经营技术”以及内蒙古科技创新引导奖励资金项目子课题“抗逆-定性经济型植物种优选——柠条新品种优选及经济性状测定”和“抗逆—定向经济型植物材料选择与扩繁技术研究（沙柳）”、内蒙古科技厅知识产权项目“沙棘果实采收专利技术与推广”等10项。获得国家新型实用专利3项。

目前，本所人员承担的项目已验收的有“十一五”林业科技支撑计划子专题“优质抗逆生态树种柠条新品种选育研究”和“抗干旱植物种质收集、栽培与生长特性研究 （抗干旱植物种质库建设）”

目前为止，本部门人员负责或参与的项目中，“呼和浩特树木园内蒙古珍稀濒危树种（14）迁地保护研究”获内蒙古林业厅科技进步三等奖，“优良花灌木的推广”和“丁香属植物引种及推广”获呼和浩特科技进步三等奖，“内蒙古林木种质资源基因库建设和繁育技术研究”获内蒙古林业厅科技贡献一等奖，“ABTY与GGR生根粉推广”获国家林业局科学技术委员会一等奖。

森林经营和保护研究所

开展森林抚育、改造与质量提升；森林和草原有害生物防治、森林草原防火等综合防治技术研究。    

景观环境研究所

    开展城乡环境景观及景观空间设计与研究；承担城市林业、林业和草原生态工程、旅游风景区、自然保护地等的设计与研究。

碳汇研究所

    开展森林、草原、湿地碳汇计量方法的研究，相关资源资产化管理及运营决策技术等方面的研究；开展造林再造林国际投资项目技术咨询与支撑，开展应对气候变化、土地利用变化和林业温室气体清单编制等研究工作。

遗传育种研究所

    开展林草种质资源收集、保护、利用、评价，种质基因库建设；乡土植物引种、良种选育等方面的研究工作。承担树木园管理工作。

科技推广与宣教中心

    开展新品种（良种）、新技术推广与示范，林业科研教育培训工作，国际合作与交流，承办《内蒙古林业》和《内蒙古林业科技》刊物。承担科研基地、沙生植物园科研与管理工作。

草原研究所

    开展草原生态系统结构、生态功能和草原生产力研究；开展退化草原修复保护与利用、草原灾害预警与防控等关键技术研究工作。

食用林产品检验检测中心

    开展食用林产品及其产地环境质量安全检测；承担相关样品的检验检测工作；承担实验室管理工作。